Международная группа экспертов по изучению средних слоев воды на борту исследовательского судна Falkor (too) Института океанологии Шмидта обнаружила более двух десятков новых морских видов во время недавней экспедиции у берегов Бразилии в тропической части Южной Атлантики. Ученые использовали передовые технологии для исследования средних слоев океана — воды между освещенным солнцем слоем и морским дном, — которая является крупнейшей и наименее изученной обитаемой экосистемой Земли. Идентификация и описание новых видов может занимать у ученых десятилетия, но сочетание технологий и опыта позволило команде подтвердить новизну этих видов всего за несколько дней.
В список входят амфипод, тип ракообразных, родственных крабам и омарам; тончайший червь, который передвигается быстрее, чем предполагают ученые, исходя из формы его тела; девять медуз; семь сифонофоров, колониальных организмов, родственных медузам и кораллам; семь гребневиков, или гребневиков, известных своими сверкающими ресничками, которые они используют для плавания; четыре личинки, головастикоподобные существа, живущие в слизистых оболочках и более тесно связанные с человеком, чем беспозвоночные; и два гигантских ризария, одноклеточных организма, видимых невооруженным глазом.
Как сообщил Осборн, команда обнаружила гораздо большее разнообразие и обилие организмов в толще воды, чем ожидала, в том числе стеклянных кальмаров и пелагического осьминога, питающегося ярко-красной медузой.
Подводные слои океана — одна из самых сложных для исследования областей на Земле из-за своей недоступности и огромного объема. Программа грантов на исследования в подводном слое океана от Фонда мира Сасакавы финансировала две программы, которые сделали эту работу возможной: одна базировалась в Университете Западной Австралии, а другая — в Бигелоуской лаборатории океанологических исследований, США.
Технологии, использованные для идентификации новых видов, представляли собой сочетание систем визуализации и генетического анализа.
В число систем визуализации входили приборы DeepPIV (метод визуализации поля скоростей частиц) и EyeRIS (система дистанционной визуализации), разработанные лабораторией биоинспирации в MBARI (Научно-исследовательский институт аквариума Монтерей-Бей), которые были установлены на дистанционно управляемом подводном аппарате (ROV) SuBastian Института океанологии Шмидта. DeepPIV и EyeRIS — это сложные неинвазивные инструменты для сканирования морских животных; они используют лазеры для сканирования организмов и создания их 3D-изображений. Кроме того, к ROV была прикреплена теневая камера от Японского агентства морских и земных наук и технологий (JAMSTEC), которая позволяет получать изображения мельчайших деталей животных, невидимых на 3D-сканах. Полученные изображения помогают ученым описывать форму и внутреннюю структуру животных без необходимости их сбора.
Многие животные, обитающие в толще воды, имеют желеобразную консистенцию, мягкие и хрупкие тела, которые часто повреждаются при использовании традиционных методов отбора проб. Для решения этой проблемы экспедиция использовала дополнительные технологии, позволившие ученым наблюдать за животными в контролируемой среде, имитирующей их естественную среду обитания. К ним относятся камера виртуальной реальности, разработанная в Университете Западной Австралии, и «гравитационная машина», разработанная в Стэнфордском университете — специализированный микроскоп, функционирующий как гидродинамическая беговая дорожка для изучения микробов.
Для получения важных новых данных о физиологии морских животных команда использовала другой микроскоп, разработанный в Стэнфордском университете. Этот микроскоп, известный как Squid, представляет собой конфокальный микроскоп с открытым исходным кодом. С помощью Squid команда впервые в истории морских исследований получила трехмерные изображения внутренних клеточных структур живых организмов. Одним из исследованных организмов был крупный одноклеточный микроб, называемый простейшим. Микроскоп позволил ученым наблюдать, как клеточная структура простейшего взаимодействует с его стеклянным скелетом.
Параллельно с получением изображений высокого разрешения команда секвенировала геномы собранных на борту судна образцов, что позволило им быстро идентифицировать новые виды под руководством доктора Шерил Эймс из Университета Тохоку и доктора Джона Бернса из лаборатории Бигелоу.